Архипелаг ГУЛАГ
На протяжении почти двух десятилетий сотни тысяч заключенных плотно заполняли помещения Кремля и отделенных скитов, осужденные жили в старых землянках, душных бараков, едва отапливаемых зданиях. Во второй половине 1930-х гг. на острова попали многие ученые, работники Коминтерна и НКВД, эмигранты, деятели культуры. Немногие пережили соловецкую ссылку. Погибшие погребены в безымянных братских могилах, разбросанных по островам.
В период Великой Отечественной войны вблизи монастыря располагался учебный отряд Северного флота. После вывода их монастыря военных моряков интерес к истории и архитектуре возобновился, начались научно-исследовательские и реставрационные работы.